Radnja igre odvija se trideset godina nakon zatvaranja originalnog restorana Freddy Fazbear's Pizza. U igri igrač preuzima ulogu noćnog čuvara u potpuno novom objektu nazvanom "Fazbear's Fright: The Horror Attraction". Cilj igrača je preživjeti pet uzastopnih noći (nivoa) u ovom jezivom muzeju posvećenom legendi o Freddyju Fazbearu.
Igra se odvija iz prvog lica, a igrač mora nadzirati sigurnosne kamere i različite sustave kako bi se obranio od animatroničkih likova koji pokušavaju provaliti u njegovu sobu. Igrač mora koristiti oštru taktiku i pažljivo upravljati resursima poput energije kako bi preživio noć i spriječio animatroničke likove da ga uhvate.
Osim toga, igra sadrži složenu priču i tajne koje igrač može otkriti kroz pronalazak skrivenih poruka i interakciju s okolinom. Five Nights at Freddy's 3 kombinira napetost noćnog čuvara s misterioznim i zastrašujućim elementima serije, čineći je izazovnom i zastrašujućom igrom za ljubitelje horora.