Permainan berlangsung di Freddy Fazbear's Pizza, sebuah restoran cepat saji yang bertemakan karakter animatronik untuk menghibur para tamu. Pemain berperan sebagai penjaga malam yang bertugas mengawasi restoran pada malam hari. Aksinya terjadi beberapa tahun sebelum kejadian di bagian pertama seri. Restoran tersebut menghadapi masalah dengan boneka animatronik yang menunjukkan perilaku tidak biasa dan menjadi agresif di malam hari.
Pemain duduk di meja keamanan dan menggunakan kamera pengintai untuk melacak pergerakan karakter animatronik melalui restoran. Tujuan permainan ini adalah untuk bertahan hidup selama lima malam berturut-turut tanpa diserang dan mengalahkan boneka animatronik. Pemain harus mengelola sumber daya seperti listrik yang menggerakkan kamera keamanan dan kunci pintu untuk bertahan dari serangan karakter animatronik.
Game ini juga menampilkan cerita mendalam dan rahasia yang dapat ditemukan pemain melalui eksplorasi dan analisis pesan serta interaksi dengan lingkungan. Five Nights at Freddy's 2 dikenal dengan momen menegangkan dan menakutkan serta memberikan pengalaman unik bagi pemainnya dalam genre game horor.