Permainan ini berlangsung tiga puluh tahun setelah penutupan restoran Pizza Freddy Fazbear yang asli. Dalam permainan, pemain berperan sebagai penjaga malam di fasilitas baru bernama "Ketakutan Fazbear: Atraksi Horor". Tujuan pemain adalah bertahan selama lima malam berturut-turut (level) di museum menyeramkan yang didedikasikan untuk legenda Freddy Fazbear.
Permainan berlangsung sebagai orang pertama, dan pemain harus memantau kamera keamanan dan sistem yang berbeda untuk bertahan melawan karakter animatronik yang mencoba masuk ke kamarnya. Pemain harus menggunakan taktik yang tajam dan dengan hati-hati mengelola sumber daya seperti energi untuk bertahan hidup di malam hari dan mencegah karakter animatronik menangkapnya.
Selain itu, game ini menampilkan cerita kompleks dan rahasia yang dapat diungkap pemain melalui pencarian pesan tersembunyi dan interaksi dengan lingkungan. Five Nights at Freddy's 3 menggabungkan ketegangan penjaga malam dengan elemen seri yang misterius dan menakutkan, menjadikannya game yang menantang dan menakutkan bagi para penggemar horor.