Setiap episode memiliki sembilan level (delapan level bos reguler dan satu level bos terakhir), ditambah level rahasia yang diaktifkan oleh tombol tersembunyi di suatu tempat di delapan level pertama. Level reguler sering kali terlihat seperti labirin atau area luas dengan banyak musuh (jumlah musuh di setiap area tergantung pada tingkat kesulitan), di mana pemain harus mencapai pintu keluar lift. Untuk melakukan ini, dia harus membunuh musuh (walaupun dimungkinkan untuk bergerak ke belakang penjaga, dan bahkan ada sedikit bonus menyerang mereka dari belakang, sebagian besar musuh harus berurusan dengan daya tembak), dan tergantung pada levelnya, aktifkan "mendorong dinding" dan/atau mendapatkan kunci perak dan emas untuk membuka pintu tertentu.
Banyak item yang ditemukan di level tersebut, mulai dari medikit, makanan, bahkan makanan anjing (untuk memulihkan kesehatan), amunisi dan harta karun, yang hanya ada untuk poin. Ada empat senjata (pisau, pistol, senapan mesin dan Gatling - senapan mesin ringan). Pisau dan pistol diberikan di awal level, sedangkan senapan mesin ditemukan (biasanya di area rahasia) atau diambil dari tentara SS, dan Gatling selalu dijatuhkan di suatu tempat di level tersebut. Ada lima jenis musuh (selain bos) - Anjing (cepat, tapi lebih mengganggu daripada mengancam jiwa), Tentara (mengenakan pakaian coklat biasa, tidak terlalu kuat, tapi biasanya ditemukan dalam kelompok besar), Petugas ( berpakaian putih, dipersenjatai dengan senjata yang sangat akurat dan sulit dibunuh), pasukan SS (berpakaian biru, dipersenjatai dengan senapan mesin dan sulit dibunuh), dan mutan (musuh reguler paling langka dan paling tangguh, tentara berkepala pucat dengan pakaian hijau dan senjata mesin).
Karakter pemain memiliki beberapa nyawa; begitu dia kehilangan nyawa terakhirnya, permainan berakhir.
Permainan ini terdiri dari delapan level berbeda, dan berikut penjelasan singkat setiap levelnya:
- "Melarikan diri dari Wolfenstein" - Level pertama permainan yang berfungsi sebagai level pengantar. Pemain memulai di selnya dan harus menemukan cara untuk melarikan diri dari penjara.
- "Operasi: Eisenfaust" - Di level ini pemain harus menemukan dan menghancurkan seorang ilmuwan ulung Nazi bernama Dr. Schabbs yang berupaya menciptakan tentara super.
- "Mati, Fuhrer, Mati!" - Pada level ini pemain harus menemukan dan membunuh Adolf Hitler.
- "Rahasia Gelap" - Di level ini, pemain harus menemukan laboratorium rahasia yang menampung proyek rahasia teknologi Nazi.
- "Jejak Orang Gila" - Di level ini, pemain harus mengikuti jejak seorang jenderal Nazi gila bernama Gretel Grosse.
- "Konfrontasi" - Di level ini, pemain harus mengalahkan tiga jenderal Nazi: Hans Gross, Dr. Schabbs, dan Gretel Gross.
- "Kembali ke Bahaya" - Di level ini, pemain kembali ke benteng untuk menghancurkan Nazi yang tersisa.
- "Tantangan terakhir" - Level terakhir permainan di mana pemain harus mengalahkan pemimpin utama Nazi dan menghindari kematian saat mengalahkan lawan terakhir.
Kontrol untuk Wolfenstein 3D bervariasi tergantung pada platform tempat Anda memainkan game tersebut. Berikut adalah kontrol dasar yang digunakan di sebagian besar versi game:
Gerakan karakter - Gunakan tombol panah atau tombol W, A, S dan D pada keyboard Anda untuk menggerakkan karakter Anda maju, mundur, kiri atau kanan.
Ganti senjata - Gunakan tombol papan angka 1 hingga 9 untuk mengganti senjata. Setiap senjata memiliki tombolnya sendiri.
Penembakan - Gunakan spasi pada keyboard Anda untuk menembakkan senjata Anda.
Interaksi dengan objek - Gunakan tombol Shift atau Kontrol untuk membuka pintu, mengambil item, atau menekan tombol.
Peta - Gunakan tombol Tab pada keyboard Anda untuk menelusuri peta level.