Help de Ninja Turtles om April te redden, die net is ontvoerd door een mysterieuze en griezelige geest. Nadat je je personage hebt gekozen (Mikey, Raph, Leo of Donnie), pak je je wapen en gebruik je al je ninjavaardigheden om je vijanden te verslaan. Je vermogen om je in de schaduw te verstoppen zal de sleutel tot je succes zijn.
