W drugiej części gry Smarty Bubbles musimy być dość szybcy w niszczeniu bąbelków, ponieważ będą one szybko przesuwać się w dół, a jeśli spadną na ziemię, to koniec gry. Celem gry jest trafienie co najmniej 3 bąbelków tego samego koloru, aby usunąć je z planszy, aż znikną całkowicie. Używamy więc „myszki” lub „palca”, aby celować w bąbelki.