Jelly Go kretsar kring premissen för söta, färgade gelévarelser som behöver fånga fiendens baser för att utöka sitt territorium. Spelare måste strategiskt skicka sina gelégodisar för att fånga neutrala och fiendebaser samtidigt som de försvarar sina egna. Varje nivå presenterar ett unikt arrangemang av baser, hinder och fiendestyrkor, som utmanar spelare att hitta det mest effektiva sättet att uppnå seger.
De kan skickas i olika förhållanden, vilket möjliggör olika attack- och försvarsstrategier. Spelare kan också använda speciella förmågor, såsom fartökningar och power-ups, för att få en fördel gentemot sina motståndare. Spelmekaniken är lätt att förstå, men att bemästra de strategier som behövs för att gå vidare genom alla 75 nivåer kräver skicklighet och eftertänksamhet.
Allt eftersom spelarna går igenom spelets 75 nivåer Jelly Go, svårigheten ökar hela tiden, och varje steg introducerar nya utmaningar och hinder. Vissa nivåer kan innehålla ytterligare typer av fiender, medan andra inkluderar miljörisker eller begränsade resurser. Spelets nivåutveckling har noggrant utformats för att upprätthålla en balans mellan utmaning och njutning, vilket säkerställer att spelarna förblir engagerade och motiverade under hela sin Jelly Go-resa.