Кожен епізод має дев’ять рівнів (вісім звичайних і останній рівень боса), а також секретний рівень, який активується прихованим перемикачем десь на перших восьми рівнях. Звичайні рівні часто мають вигляд лабіринту або великих зон з великою кількістю ворогів (їх кількість у кожній зоні залежить від рівня складності), де гравець повинен дістатися до вихідного ліфта. Для цього він повинен вбивати ворогів (хоча можна рухатися позаду охоронців, і навіть є невеликий бонус атакувати їх ззаду, більшості ворогів доводиться мати справу з вогнем), і залежно від рівня активувати «штовхання» стіни» та/або отримати срібні та золоті ключі, щоб відкрити певні двері.
На рівні можна знайти багато предметів, від аптечок, страв і навіть корму для собак (для відновлення здоров’я), амуніції та скарбів, які існують лише за очки. Є чотири види зброї (ніж, пістолет, кулемет і гатлінг - ручний кулемет). Ніж і пістолет дають на початку рівня, тоді як кулемет або знаходять (зазвичай у секретних зонах), або забирають у солдата СС, а Гатлінг завжди скидають десь на рівні. Існує п’ять типів ворогів (крім босів) – собаки (швидкі, але більше неприємні, ніж небезпечні для життя), солдати (одягнені у звичайний коричневий одяг, не дуже сильний, але зазвичай зустрічаються великими групами), офіцери ( одягнені в біле, озброєні дуже точним пістолетом, яких важко вбити), війська СС (блакитний одяг, озброєні кулеметами, яких важко вбити), і мутанти (найрідкісніші та найжорсткіші штатні вороги, блідоголові солдати в зеленому одязі та кулемети).
У персонажа гравця є кілька життів; коли він втрачає своє останнє життя, гра закінчується.
Гра складається з восьми різних рівнів, і ось короткий опис кожного рівня:
- "Втеча з Wolfenstein" - Перший рівень гри, який служить вступним рівнем. Гравець починає зі своєї камери і повинен знайти спосіб втекти з в'язниці.
- "Операція: Ейзенфауст- На цьому рівні гравець повинен знайти та знищити вченого-нациста на ім’я доктор Шаббс, який працює над створенням суперсолдата.
- "Здохни, фюрер, здохни!" - На цьому рівні гравець повинен знайти і вбити Адольфа Гітлера.
- "Темна таємниця- На цьому рівні гравець повинен знайти секретну лабораторію, в якій знаходиться секретний нацистський технологічний проект.
- "Слід божевільного" - На цьому рівні гравець повинен піти по слідах божевільного нацистського генерала на ім'я Гретель Гроссе.
- "Конфронтація- На цьому рівні гравець повинен перемогти трьох нацистських генералів: Ганса Гросса, доктора Шаббса і Гретель Гросс.
- "Повернення до Небезпеки" - На цьому рівні гравець повертається до фортеці, щоб знищити нацистів, що залишилися.
- "Остаточний виклик" - Останній рівень гри, де гравець повинен перемогти головного лідера нацистів і уникнути смерті, перемагаючи останніх супротивників.
Елементи керування для Wolfenstein 3D відрізняються залежно від платформи, на якій ви граєте в гру. Ось основні елементи керування, які використовуються в більшості версій гри:
Рух персонажа - Використовуйте клавіші зі стрілками або клавіші W, A, S і D на клавіатурі, щоб рухати персонажа вперед, назад, ліворуч або праворуч.
Змінити зброю - Використовуйте цифрові клавіші від 1 до 9, щоб змінити зброю. Кожна зброя має свою кнопку.
Зйомка - Використовуйте пробіл на клавіатурі, щоб стріляти зі зброї.
Взаємодія з об'єктами - Використовуйте клавішу Shift або Control, щоб відкривати двері, підбирати предмети або натискати кнопки.
Карта - Використовуйте клавішу Tab на клавіатурі, щоб переглядати карту рівнів.