Svaka epizoda ima devet razina (osam redovnih i konačna boss level razina), plus tajnu razinu aktiviranu skrivenom sklopkom negdje na osam prvih razina. Redovne razine često imaju izgled labirinta ili velika područja s mnogo neprijatelja (broj njih na svakom području ovisi o razini težine), gdje igrač mora stići do izlaznog dizala. Da bi to učinio, mora ubiti neprijatelje (iako je moguće kretati se iza leđa stražara, pa čak i postoji blagi bonus napada na njih odostraga, većina neprijatelja mora se nositi s vatrenom snagom), i ovisno o razini, aktivirajte "gurajuće zidove" i / ili nabavite srebrne i zlatne tipke za otvaranje određenih vrata.
Mnogi se predmeti nalaze u razini, od medikita, obroka, pa čak i hrane za pse (za obnavljanje zdravlja), municije i blaga, koji postoje samo za bodove. Postoje četiri oružja (nož, pištolj, mitraljez i Gatling - laka strojnica). Nož i pištolj daju se na početku razine, dok se mitraljez ili nalazi (obično u tajnim područjima) ili se uzima od SS vojnika, a Gatling se uvijek spušta negdje u razini. Postoji pet vrsta neprijatelja (osim šefova) - Psi (brzi, ali više smetnja nego opasni po život), vojnici (obučeni u uobičajenu smeđu odjeću, ne baš moćni, ali obično se nalaze u velikim skupinama), oficiri (obučeni u bijelo , naoružani vrlo preciznim pištoljem i teškim za ubijanje), SS trupe (plava odjeća, naoružana mitraljezom i teška za ubijanje), i mutanti (najrjeđi i najstroži redoviti neprijatelji, blijedoglavi vojnici sa zelenom odjećom i mitraljezom).
Lik igrača ima nekoliko života; jednom kad izgubi posljednji život, igra se završava.
Igra se sastoji od osam različitih nivoa, a ovdje je kratak opis svake razine:
- "Escape from Wolfenstein" - Prva razina igre koja služi kao uvodna razina. Igrač počinje u svojoj ćeliji i mora pronaći način da pobjegne iz zatvora.
- "Operation: Eisenfaust" - U ovoj razini igrač mora pronaći i uništiti glavnog nacističkog znanstvenika po imenu Dr. Schabbs koji radi na stvaranju super-vojnika.
- "Die, Fuhrer, Die!" - U ovoj razini igrač mora pronaći i ubiti Adolfa Hitlera.
- "A Dark Secret" - U ovoj razini igrač mora pronaći tajni laboratorij u kojem se nalazi tajni projekt nacističke tehnologije.
- "Trail of the Madman" - U ovoj razini igrač mora pratiti tragove ludog nacističkog generala po imenu Gretel Grosse.
- "Confrontation" - U ovoj razini igrač mora pobijediti tri nacistička generala: Hansa Grosse, Dr. Schabbsa i Gretel Grosse.
- "Return to Danger" - U ovoj razini igrač se vraća u tvrđavu kako bi uništio preostale naciste.
- "Ultimate Challenge" - Zadnja razina igre u kojoj igrač mora pobijediti glavnog nacističkog vođu i izbjeći smrt dok pobjeđuje zadnje protivnike.
Kontrole za Wolfenstein 3D variraju ovisno o platformi na kojoj igrate igru. Evo osnovnih kontrola koje se koriste u većini verzija igre:
Kretanje lika - Koristite tipke sa strelicama ili tipke W, A, S i D na tipkovnici da biste kretali lika naprijed, nazad, lijevo ili desno.
Promjena oružja - Koristite tipke brojčane tipkovnice od 1 do 9 da biste promijenili oružje. Svako oružje ima svoju tipku.
Pucanje - Koristite tipku razmaka na tipkovnici da biste ispalili oružje.
Interakcija s predmetima - Koristite tipku Shift ili Control da biste otvorili vrata, pokupili predmete ili pritisnuli gumbe.
Mapa - Koristite tipku Tab na tipkovnici da biste pregledali mapu nivoa.
