Radnja igre odvija se u Freddy Fazbear's Pizza, restoranu brze hrane koji ima tematske animatroničke likove za zabavu gostiju. Igrač preuzima ulogu noćnog čuvara koji je zadužen za nadzor restorana tijekom noćnih sati. Radnja se dešava nekoliko godina prije događaja u prvom dijelu serije. Restoran se suočava s problemima s animatroničkim lutkama koje pokazuju neobično ponašanje i postaju agresivne tijekom noći.
Igrač sjedi za sigurnosnim stolom i koristi nadzorne kamere kako bi pratio kretanje animatroničkih likova kroz restoran. Cilj igre je preživjeti pet uzastopnih noći bez da budete napadnuti i poraziti animatroničke lutke. Igrač mora upravljati resursima poput električne energije koja napaja sigurnosne kamere i bravu na vratima kako bi se obranio od napadačkih animatroničkih likova.
Igra također sadrži duboku priču i tajne koje igrač može otkriti kroz istraživanje i analizu poruka te interakciju s okolinom. Five Nights at Freddy's 2 je poznata po svojoj napetosti i strašnim trenucima te je pružila igračima jedinstveno iskustvo u žanru horor igara.